Asistensi Jepang dalam pembangunan pertanian Indonesia setidaknya telah berlangsung selama hampir 50 tahun. Berawal dari proyek rehabilitasi irigasi yang terkait erat dengan peningkatan produktivitas padi pada 1970-an, Negeri Sakura pun mulai membidik bantuan teknis yang berfokus pada penerapan praktik pertanian yang baik serta efektivitas rantai pasok.